The Old Town: Heraklion vokste rundt sjøen og fortsatt styrer den gamle byen på havnen, med den mest bemerkelsesverdige monument Koules, en imponerende 16. århundre festning bygget av venetianerne. Du kan klatre på vollene for en vakker utsikt. Herfra kan du se arsenaler, vidstrakte buer med hvelvede rom hvor venetianerne har reparert sine skip og den travle promenaden ved sjøen, foret med sjømat restauranter. Gamlebyen er beskyttet av en krets av massive forsvarsmurer, som er delvis revet. Innenfor fotgjenger gater er fulle av aristokratiske bygninger, kirker og butikker, åpning på en løvrikt torg med fontener og travle kafeer.
Slottet i Knossos: Det største og best bevarte minoiske stedet på Kreta ligger fem kilometer sørøst for Heraklion, lett tilgjengelig med lokal buss. En stor monumental palass, med fire vinger bygget rundt en stor sentral gårdsplass, er det antatt at Knossos var den mytiske labyrint av kong Minos. Bemerkelsesverdig raffinerte, det inneholdt seremonielle rom, boarealer, oppbevaringsrom, omfattende dekorasjon og et komplekst dreneringssystem. Selv utgravninger viser at det hadde vært et palass for Kristus i 2000, hva du ser i dag er hovedsakelig fra 1450 f.Kr., med en noe fantasi rekonstruksjon av det tidlige 20. århundre og mange kopier av fresker (originalene er i arkeologi Museum of Heraklion).
Det arkeologiske museet i Heraklion: vakre 3,500 år gamle fresker av Knossos, kan ses i dette museet. Mens hovedbygningen av museet er stengt for oppussing siden 2006, se denne utmerkede midlertidig utstilling av ca 450 gamle funn av øya fortsatt se kronologisk ordnet med forklarende tekster i både gresk og engelsk. Dette verdensklasse museet er den viktigste turistattraksjonen i Heraklion, og ligger i den østlige delen av den gamle byen.
Kretas historiske museum: med en rekke utenlandske okkupanter er Kretas historie komplisert, men fascinerende. Dette museet har 1700 års historie på øya, fra tidlig kristen tid til moderne tid. Du ser religiøse ikoner, stein skulpturer, keramikk, tekstil og kostymer fra de bysantinske, venetianske og tyrkiske perioder, samt en dyster plass dedikert til det kretiske motstandsbevegelsen og de som døde under andre verdenskrig. Du finner museet i et restaurert herskapshus, en 10-minutters spasertur vest for den gamle havnen.
Cretaquarium Thalassocosm: I dette store moderne akvariet kan du oppleve Middelhavet under vann. En fascinerende dag ut for barn og voksne, har det 32 store glass tanker med alt fra haier til små sjøhester, maneter, havskilpadder, hummer og blekksprut, alt i vakkert opplyst turkis hav mot en bakgrunn av stein, sand og tang. Du finner akvariet på en tidligere amerikansk militærbase i Gournes, 13 kilometer øst for Heraklion.
El Greco Museum, Fodele: I det 16. århundre var Heraklion hjem for en viktig skole av religiøse ikonmalere. Ett av medlemmene, Dome Theotokopoulos (1541-1614), ble senere en artist i verdensklasse, bedre kjent som El Greco. Han ble født i den enkle landsbyen Fodele, midt i appelsinlunder 28 kilometer vest for Heraklion. I dag er steinhuset der han ble født et museum. Theotokopoulos flyttet til Spania i 1577 og bodde og jobbet der til hans død. Hans malerier er kjent for sine intense farger og drama, og du kan se flere reproduksjoner av hans verk her.